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功能基因知多少

 ?。ㄖ袊?guó)豬業(yè)報(bào)道)繼9月16日上午一場(chǎng)我國(guó)地方豬種資源的保護(hù)與利用大講堂后,中國(guó)豬業(yè)科技大會(huì)育種與遺傳資源論壇功能基因組專場(chǎng)會(huì)場(chǎng)在9月16日下午舉行,會(huì)議由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)趙書紅教授和西北農(nóng)林科技大學(xué)任軍教授主持。

 

   圖:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)任軍教授

  增加豬肋骨數(shù)的精準(zhǔn)育種技術(shù)及其分子機(jī)理

  江西農(nóng)業(yè)大學(xué)任軍教授指出,不同豬群的胸腰椎骨數(shù)存在差異,一般是19~24根不等,日本和江西農(nóng)業(yè)大學(xué)研究小組揭示影響豬脊椎骨的主效基因有2個(gè),分別位于1號(hào)和7號(hào)染色體,均可解釋約1根的脊椎數(shù)表達(dá)變異。在研究中,通過GWAS分析和薈萃分析等方法篩選到2個(gè)基因VRTN和SYNDIG1L,其中VRTN已被報(bào)道為影響脊椎數(shù)的候選基因。通過多方查證后,對(duì)該基因的功能進(jìn)行了一系列驗(yàn)證,最終驗(yàn)證結(jié)果揭示VRTN基因是一個(gè)新的轉(zhuǎn)錄因子,且是調(diào)控胸椎發(fā)育的關(guān)鍵基因。此外,VRTN可能通過加快分節(jié)鐘增加胸椎的數(shù)量。最終得出的結(jié)論是VRTN基因是影響中西方豬胸椎(肋骨)數(shù)的主效基因,VRTN因果突變具有“一因多效”性,增加1根肋骨、同時(shí)增加0.5個(gè)乳頭數(shù)、成年豬體長(zhǎng)增加1.5cm,產(chǎn)肉量增加1%以上,同時(shí) 不會(huì)對(duì)其他生長(zhǎng)性狀產(chǎn)生負(fù)面效應(yīng),非常適合中西方豬種的遺傳改良。VRTN增加肋骨數(shù)的優(yōu)勢(shì)等位基因很可能起源自中國(guó)地方豬種。VRTN是胚胎發(fā)育所必需的一種轉(zhuǎn)錄因子,通過調(diào)節(jié)Notch2等基因的表達(dá)來調(diào)控胸椎體節(jié)分節(jié)速度,從而最終影響胸椎(肋骨)數(shù)。

 

  圖:PIC 亞洲區(qū)產(chǎn)品性能總監(jiān)David Casey

  PIC 亞洲區(qū)產(chǎn)品性能總監(jiān)David Casey介紹了《PIC 遺傳改良計(jì)劃》,他從遺傳核心場(chǎng)選育的指標(biāo)、商品場(chǎng)數(shù)據(jù)、基因組選擇1.0、基因組選擇2.0、中國(guó)數(shù)據(jù)結(jié)果5方面對(duì)PIC的育種情況進(jìn)行了介紹,通過測(cè)定種豬場(chǎng)種豬的遺傳性狀,選育種豬的形狀,旨在為客戶提供更好的種豬。最后指出,在遺傳核心場(chǎng)的選育是基礎(chǔ),商品場(chǎng)的數(shù)據(jù)對(duì)于客戶的生產(chǎn)表現(xiàn)非常重要,基因組選擇1.0已經(jīng)取得了成功,2.0將是未來的目標(biāo)。

 

  圖:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)趙書紅教授

  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)趙書紅教授介紹了《整合多組學(xué)數(shù)據(jù)鑒定豬重要性狀功能基因及突變位點(diǎn)》,通過3個(gè)部分的研究展示了研究組的成果。一是通過研究發(fā)現(xiàn)高飼料轉(zhuǎn)化效率的個(gè)體豬的食欲基因更加活躍,且豬的肝臟和肌肉能量代謝下降、能量?jī)?chǔ)存能力增強(qiáng)。骨骼肌細(xì)胞分化與飼料轉(zhuǎn)化效率之間的關(guān)系還需要進(jìn)一步研究。二是針對(duì)一些免疫相關(guān)基因進(jìn)行分子水平的研究,發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子區(qū)域突變可引起轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合能力變化從而影響基因表達(dá),進(jìn)而影響性狀表達(dá)。編碼區(qū)突變可能影響蛋白結(jié)構(gòu)域變化從而影響在細(xì)胞膜上的定位。三是規(guī)劃未來的工作方向是豬DNA結(jié)構(gòu)3D圖譜的構(gòu)建,從三維結(jié)構(gòu)的角度與揭示更多的關(guān)鍵調(diào)控元件和基因的突變位點(diǎn)。

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   圖:會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)

 

  圖:各大院校及研究院的演講嘉賓

  來自各大院校及研究院的演講嘉賓報(bào)告內(nèi)容:

  山西農(nóng)業(yè)大學(xué)李步高:《晉汾白豬純繁選育與配套雜交研究》

  南京農(nóng)業(yè)大學(xué)陳若男:《母豬發(fā)情征狀的候選基因挖掘》

  中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)張金鑫:《基于系譜和芯片信息群體間親緣關(guān)系研究》

  山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所王繼英:《TNFRSF1A 基因CpG 島甲基化與基因表達(dá)及T 淋巴細(xì)胞亞群指標(biāo)的相關(guān)性分析》

  安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)田密:《基于高通量測(cè)序技術(shù)篩選豬卵巢卵泡期到黃體期轉(zhuǎn)變的關(guān)鍵基因和microRNA》

  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)柴進(jìn):《基于組學(xué)策略揭示清平豬短妊娠期分子機(jī)制》

  中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)葉?。骸蹲胸i均勻度與斷奶至配種間隔遺傳參數(shù)估計(jì)與影響因素分析》

  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所王立剛:《大白豬一步法全基因選擇參數(shù)研究》

  揚(yáng)州大學(xué)孫麗:《豬miR-192對(duì)DLG5和ALCAM 基因的靶向作用關(guān)系驗(yàn)證分析》

  甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)黃曉宇:《C 型產(chǎn)氣莢膜梭菌性腹瀉仔豬回腸LncRNAs 表達(dá)譜研究》

  揚(yáng)州大學(xué)欽偉云:《梅山豬不同發(fā)育時(shí)期不同腸段微生物結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)分析》

 

   圖:現(xiàn)場(chǎng)互動(dòng)

 

 

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